Il existe principalement cinq types de substances pour le chakra à savoir le feu, le vent, l'eau, la foudre et la terre. Ces cinq éléments sont à l'origine des noms des "cinq grands pays shinobi" et constituent la base de tout ninjutsu. En général, tout le monde possède un chakra ayant des affinités avec un des cinq éléments. Par exemple, le clan Uchiha possède des affinités avec le feu, et a donc des facilités à maîtriser le "Katon".

Les techniques du ninjutsu font appel à ces éléments ci dessous :
Le Katon : l'art de manipuler le feu
Le Suiton : l'art de manipuler l'eau
Le Fûton : l'art de manipuler le vent
Le Doton : l'art de manipuler la terre
Le Raiton : l'art de manipuler la foudre
Le Hyoton : l'art de manipuler la glace
Le Mokuton : l'art de manipuler le bois.
Par exemple, le Chidori est une technique de type Raiton.

Pour savoir son affinité, il faut prendre un papier spécial qui réagit facilement avec le chakra. Il est fabriqué à partir d'un arbre très particulier qui absorbe le chakra pour se nourrir. En imprégnant ce papier du chakra de la personne qui souhaite savoir son affinité, il pourra déterminer ainsi quel type il est.

S'il est de type vent, la feuille se coupe.
S'il est de type feu, la feuille brûle
S'il est de type eau, la feuille s'humidifie.
S'il est de type terre, la feuille se déchire.
S'il est de type foudre, la feuille se froisse.

Certaines personnes possèdent deux affinités. Tout ceux qui accèdent au rang de jounin, possèdent en général plus de deux types. Dans le cas où l'on possède deux types de substance, il est facile de les utiliser indépendamment mais lorsqu'il s'agit de les manier en même temps c'est autre chose. Utiliser simultanément deux types de substance, pour en créer un nouveau. On appelle cela le Kekkei Genkai.
En combinant le Suiton et le Doton, on obtient le Mokuton.
En combinant le Fuûton et le Suiton, on obtient le Hyoton.

Par exemple, Haku utilisait le Hyoton. Il le développait en manipulant simultanément le vent et l'eau. C'est un jutsu spécial n'appartenant qu'à un clan possédant le Kekkei Genkai. C'est pour cela que Kakashi ne pouvait pas le copier en utilisant le Sharingan.

Les cinq affinités (qui font appel aux cinq éléments principaux) ont tous des points faibles entre elles:

 Katon a Fûton a Raiton a Doton a Suiton

Ce schéma représente les points faibles de chacune des affinités. Ainsi :
Le Katon est supérieur au Fûton. Mais le Katon est inférieur au Suiton
Le Fûton est supérieur au Raiton. Mais le Fûton est inférieur au Katon.
Le Raiton est supérieur au Doton. Mais le Raiton est inférieur au Fûton
Le Doton est supérieur au Suiton. Mais le Doton est inférieur au Raiton.
Le Suiton est supérieur au Katon. Mais le Raiton est inférieur au Doton.

LES DIFFÉRENTES AFFINITES

Le Katon
Le Katon permet de lancer une attaque de feu. Cela permet de créer des boules de feu ou bien de créer un lance flamme. C'est une très bonne affinité pour les attaques à distance et à mi-distance. Elle peut même se combiner avec certaines armes comme le shuriken. C'est l'affinité principale que possède les ninjas du clan Uchiha.

Le Fûton
Le Fûton est capable de couper, trancher, pourfendre, c'est un chakra très puissant pour le combat. Très bonne affinité à longue distance mais aussi au combat rapproché, le Fûton permet de lancer des rafales de vents. Naruto en autre a cette affinité.

Le Raiton
Le Raiton est une affinité utilisant des techniques à base de foudre. Les deux ninjas actuellement connus qui possède cette affinité sont : Sasuke et Kakashi. Cette affinité est très pratique dans les combats rapprochés. Elle permet aussi de transpercer son adversaire ou bien de se protéger grâce à l'éclair produit.

Le Doton
Le Doton utilise des techniques à base de terre et de boue. C'est une excellente affinité pour attaquer à longue distance. Cela permet de créer des éboulements, des torrents de boue ou bien un encore un clone. Kakashi utilise notamment une technique qui lui permet d'enterrer un adversaire au sol.

Le Suiton
Le Suiton utilise des techniques à base d'eau. Cette affinité permet de créer un raz de marée surpuissant ou bien de se protéger en créant un mur d'eau. L'utilisateur de cette affinité peut même emprisonner un adversaire en créant une prison aqueuse. Le Suiton est principalement utilisée par Kirigakure No Sato. Le Nindaime Hokage est l'un des plus grands ninja qui utilise le Suiton.

Le Mokuton
Le Mokuton est une technique héréditaire qui combine à la fois le Suiton et le Doton. Cela permet à son utilisateur des faier pousser des arbres n'importe où. Le Shodai Hokage était le premier à avoir utilisé cette technique. il est devenu Hokage grâce à sa maîtrise de son Mokuton et notamment grâce à la technique du Mokuton Hijutsu : Jukai Kotan. Il y a des années, Orochimaru rassembla des informations sur le génome du Shodai Hokage à partir de son corps et il fit une expérience dans laquelle il implanta les gênes du

Shodaime dans les cellules de 60 enfants. Mais leur corps ne semblait pas apprécier l'intrusion d'un ADN étranger, ils moururent les uns après les autres et il n'y eu qu'un seul survivant : Yamato. Celui-ci est maintenant le seul encore vivant à savoir maîtriser le Mokuton. Elle est très pratique pour emprisonner un adversaire.

Le Hyoton
Le Hyoton est une technique héréditaire qui combine à la fois le Suiton et le Fûton. Celui-ci est capable d'utiliser l'eau et ensuite la geler. La glace d'Haku était très solide face à des attaques de type feu, la glace ne fondant que très peu. En utilisant sa capacité spéciale, il a pu développer une technique du nom 'Les Démoniaques Miroirs de Glace". Elle permet de créer plusieurs miroirs de glace autour de l'adversaire ainsi celui-ci ne peut s'échapper. Haku qui peut rentrer dans ces miroirs peut se déplacer

et attaquer ses adversaires. Dans le premier film Naruto, nous voyons des ninjas de Yugigakure utilisés de technique de Hyoton. Cependant, ce n'est pas une technique héréditaire car ces ninjas utilisent la glace qui existe déjà or Haku l'a créée.